流式数据分析软件Flowing下载

哪一款流式数据分析软件最合适？如果你是不差钱的玩家，那就推荐购买Flowjo或者Kaluza Analysis，需好几万软妹币的授权费，破解版要么是功能受限，要么是试用期30天。因此如果追求最佳性价比，那就使用本文推荐的利器-Flowing。

软件名称：Flowing
来自国家：芬兰
界面语言：英文
官方网站：点击进入
使用功能：流式细胞数据分析
授权详情：永久免费
适用平台：windows系列电脑
功能介绍：该软件运行需要安装.net framework 3.5支持，首次打开按照提示在线安装即可。该软件支持.FCS和.LMD格式的流式数据文件，但是对文件体积较大的LMD兼容不如FCS格式。它具备Flowjo基本95%的功能，而且还具有自己的特色之处。

该软件的分析流程和其它软件略有不同，在打开数据文件之前需要先利用Visualization Tools下面的Plot或Histogram先绘制出图框（可绘制普通散点图，也可绘制密度图、直方图、叠加直方图，叠加直方图后面讲），再选择数据文件。

更改坐标参数，和其它软件类似，都是在坐标上鼠标右键选择。设门，则是在图上空白区域点鼠标右键，选择Create new Region，至于门的名称、颜色、逻辑组合、删除，都是在右侧Populations窗口鼠标右键执行，这些功能我觉得比Flowjo好用，尤其是逻辑组合：

对于需要获取稀有事件的同学，会获取百万级别的细胞，此时，细胞群之间的分界就看不清楚，为此，就需减少显示的细胞数量，以便圈门。Flowjo有这功能，Kaluza直到新的2.0版本才具备此功能，而Flowing在5年前就具备了此功能，而且其选择数据的功能十分多样。在上图所示的菜单中，选择Data Reduction Tools下面的Reduce Event Number：界面出现一个空白框Event Number Reducer；选中该框，选择FCS文件后，然后鼠标右键选择减少事件的方法，可选择固定的数量，也可选择百分比，可选择从文件头取，也可以按照隔行取事件，最后将这个Event Number Reducer与散点图连接，即可显示数量减少后的图形：

不同数据文件之间，如果两个峰比较明显，但是其分群位置略有变动，大家经常需要自己去手动调，少许几个文件还好说，如果上百个数据一个个去调，要累死人的。Flowing就有自动微调功能，不知道是否孤陋寡闻，这个功能我觉得还是非常特色的，很少有软件有此功能。首先画一个Histogram，然后在上面分别画阳性峰和阴性峰的Region，这一步一定要做：

接着，从菜单Create→Region Control Tools下选择move Regions over Negative and Positive Populations：

将图形与该功能框连接后，默认是显示Non Active的：

鼠标右键点击该框，选择Active Control即可。

至于其中自动调整的算法，有三种算法可选，大多数用第一种，如果峰的分隔不是特别好或第一种调坏了，你可选择后面两种：

接下来用菜单中的Next file in directory或快捷键Ctrl＋N切换到下一个文件：

看下图的效果：

Flowing的补偿调节虽然没有商业软件可视化拖动滑动条那么简单，但相对来说，也算是比较清晰容易了。首先选择Create→Data modification tools下面的Compensate Data功能：

出现一个空白框，将该框与已选择FCS文件的散点图连接（注意箭头朝向），然后按照下图的数字标识依次进行操作：Edit modifications→窗口中选择调节补偿的参数，Remove第一个参数 From第二个参数→点击Save之后，调整Spillover值，就可以看到散点图上的图形补偿发生了变化：

选择Create→Visualization Tools下的Overlay Histogram：

接着将其它多个直方图与此框连接（箭头指向此框），即可完成叠加，但是坐标要求名称一致：

这里有FLOWER要问了，我要给直方图加上颜色，好办，只要给那两个普通的直方图加上颜色，叠加直方图也会自动显示透明色的：

商业软件的批处理都有做进去，Flowing的批处理也一点不逊色。例如我要统计某个抗原表达率，逐级设门后，最后选择抗原表达的直方图或散点图，鼠标右键菜单中选Create Statistics ，就会出现Statistics框，将常见参数都显示出来了，这只是第一步，接下来在Statistics框上再点击鼠标右键，选择Create StatList，接下来，只需在散点图或直方图上，按Ctrl＋N或Ctrl＋P前后切换数据，就会看到StatList上不断有数据添加上去，最后只需复制StatList上的数据即可。

软件下载：解压后，首次运行需联网安装.net framework 3.5支持，即可运行使用！

  Flowing软件包.zip (541.0 KB, 55 次)
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